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《Nature Methods》大脑地图图解

生物通 2023-05-13

一个被称为神经图谱的数据库有望帮助科学家发现不同大脑区域、空间尺度、模式和大脑功能之间的关系。它提供了一个标准化的空间来查看每个地图之间的比较,并评估这些比较的统计意义,以帮助研究人员从随机模式中区分有意义的相关性。神经图谱数据库还有助于将不同图谱的代码标准化。

多年来,出现了多种“大脑地图”,每一种都关注不同的大脑过程,从新陈代谢到认知功能。虽然这些地图很重要,但单独使用它们会限制研究人员从中得出的发现。


现在,来自蒙特利尔神经学研究所的一个团队和其他研究人员在一个地方汇集了40多张现有的大脑地图。这个被称为神经图谱的数据库有望帮助科学家发现不同大脑区域、空间尺度、模式和大脑功能之间的关系。该数据库提供了一个标准化的空间来查看每张地图的相互比较,并评估这些比较的统计意义,以帮助研究人员从随机模式中区分有意义的相关性。神经图谱数据库还有助于标准化跨图谱的代码,以提高结果的可重复性。


科学家们在《Nature Methods》杂志上发表了这项研究“神经图谱:脑图谱的结构和功能解释”,并在github上公开了他们的数据。


神经图谱中的一些脑图样本

“成像技术越来越多地用于生成大脑结构和功能的高分辨率参考地图。将实验生成的地图与这些参考地图进行比较有助于跨学科的科学发现。尽管最近的数据共享计划增加了大脑地图的可访问性,但数据经常在不同的坐标系中共享,阻碍了系统和准确的比较,”研究者写道。“在这里,我们介绍了神经图谱,一个用于访问、转换和分析大脑结构和功能注释的工具箱。我们实现了在四个标准坐标系之间生成高质量转换的功能。工具箱包括策划的参考地图和人类大脑的生物本体论,如分子、微观结构、电生理、发育和功能本体论。通过一套空间自相关保留零模型,可以实现对地图与地图相似度的可靠定量评估。神经图谱将开放获取的数据与透明的功能相结合,用于标准化和比较大脑图谱,为人类大脑的全面结构和功能注释丰富分析提供了系统的工作流程。”


“最终,我们希望神经图谱将为人类大脑图谱的分析增添火花,并增加具有不同研究兴趣的人对数据和软件工具的可及性,”博士生、论文的共同第一作者Justine Hansen说。“随着该领域生成新的大脑图谱的速度持续增长,我们希望神经图谱将为研究人员提供一套标准化的工作流程,以便更好地理解这些数据可以告诉我们关于人类大脑的什么。”

参考文献

neuromaps: structural and functional interpretation of brain maps




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