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颜宁反驳“AI失业论”!​结构生物学不仅仅看蛋白质Fold(折叠)

科研动态 2022-11-12

最近,颜宁博士宣布全职回国创办深圳医学科学院,引起了社会各界的热议。


对于颜宁回国的原因众说纷纭,其中甚嚣尘上的是AI解析蛋白太先进,颜宁可能要失业,所以不得不见好就收了....

诚然,以AlphaFold为代表的AI技术对蛋白质结构预测的进展迅速。


2018年12月,AlphaFold成功预测了43种蛋白质中25种的最准确结构。


2022年7月,AlphaFold数据库中发布了超过2亿个预测的蛋白质结构,几乎涵盖了所有已知的蛋白质。


近日,颜宁对此进行了有理有据的“反驳”,小编感觉怼的很痛快!


久做娱乐博主的好处是对网上各种匪夷所思的奇谈怪论,真的可以做到心如止水置之不理(主要是我压根也没时间看),毕竟娱乐圈更夸张的多了去了。


但是这两天有发自内心爱护我的师友总喊我辟谣,我真的很忙啊(忙到现在才瞜一眼微博,容易么我)。八竿子打不着、错漏百出、但凡花一个钟头读论文也不至于那么眼瞎的碰瓷文章,给眼神都浪费时间,为啥要我辟谣啊?有朋友想写澄清文章也被我拦了,好意心领了,但真犯不着(当然,如果将来某天SMART的法务看不下去了有什么行动,我就不拦了,反正现在小伙伴们已经默默地该截屏截屏,该存档存档--谢谢目前在厦门那位,从你那受的启发祝好运


【无缝切换到科普博主】去年8月8日,给了一个报告,讨论了AlphaFold的局限性;到今年的11月11日,发现去年的报告还是可以一张都不用改。


简而言之,我专注的电压门控钠离子和钙离子通道的几个关键问题(electromechanical coupling, ion selection, MOA of drugs and toxins),AlphaFold在我们过去解析的诸多结构的基础上,去年的预测达到了我们2017年的水平;今年依旧停留在我们2017年的水平(这里仅针对Nav/Cav)。在与专门做结构预测的AI团队合作,他们做预测我们做实验,测试新型小分子与蛋白的相互作用,迄今为止预测无一正确。


结构生物学不仅仅是看到Fold(折叠),更要理解蛋白质的动态变化,要理解与其他生物大分子或者调节小分子的相互作用,要理解在细胞原位里的状态,这些都是AI目前尚无能为力的领域,因为尚没有足够的数据库去训练它。举个例子,我们Cav2.2的结构去年发表晚了,尚未放在数据库里被AlphaFold用来训练,所以它预测的模型就与实验结构严重不符。



真正的研究者都乐于拥抱技术进步,善用各种技术去探寻、解答自己感兴趣的问题。事实上,我期待AI越来越强大,如果它真的可以强大到把我上述提的三个理解都实现,那我们真可以正儿八经从化学角度研究生命起源了。


【恢复傲娇毒舌本色】之前跟一个密友逗贫:做PI(principal investigator) 第一惨是想做实验没经费;第二惨则是大把启动经费才用一半就挥挥手要走了,不带走一叨乐。准备做PI的孩子们,记住在求职的时候,启动经费越多越好,因为那是你做科研最自由的fund。啥叫endowed chair (讲席教授)啊?这不只是个荣誉头衔,背后那是真金白银捐赠来的让你自由探索的经费,有这种不用写proposal的unrestricted fund,多想不开才非要申请NIH的啊(当然,还是要申请一两个嘛,否则我替闲人说:你看,申请不到吧)

颜宁成为很多人心目中的女神、榜样,不是因为她是否选上了院士,而是她正直、豁达、率真的性格,和敢与错误观点正杠的勇气和霸气!而“做真我”,对于现今一个普通人而言都不一定能做到,更何况像她这样的知名公众人物......


颜宁博士,顶你哦!   

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