使用 plotly 绘制旭日图

简介

最近需要绘制一个图来说明不同类别之间的层次结构。于是想到了旭日图（多层饼图）。类似于以下图形：

这种图表将数据层次结构呈现为一个圆形区域，其中每个环代表一个层级，而每个扇区表示该层级下的子类别或分支。每个圆环代表层次结构中的一个级别，中心圆点表示根节点，层次结构从这个点往外推移。

注意：旭日图常用于可视化具有多级分类的数据，例如组织架构、文件目录、产品分类等。它能够帮助用户快速理解数据的结构和组成，并从整体和局部两个层面上进行分析和比较。

本教程将使用 plotly^[1] 构建旭日图。通过一个简单的案例来说明，读者可以通过替换数据集，即可轻松为己所用。

注意：为小编在科研中学习的笔记，如果觉得有帮助，欢迎一键三连！类似文章如：使用 ggpubr 包制图；使用 ggcharts 高亮部分内容；基于 ggridges 绘制剩余使用寿命密度图；使用 ggTimeSeries 包构建日历图。

教程

本教程主要参考 plotly 官网例子^[2]，相关教程还可在《R语言数据可视化之美》P253页^[3]、Custom interactive sunbursts with ggplot in R^[4]、初探R语言可视化交互式包plotly——旭日图^[5]中找到。

完整代码和数据可在我的 Github 中找到：https://github.com/liangliangzhuang/R_example。欢迎关注和 star。

数据介绍

在绘制图形中，最为关键的一步是整理数据。这里以一个简单的数据集作为案例，读者只需要了解表格是如何构成，并根据实际情况进行替换即可。

此时，数据结构如下所示：

由三列组成，其中 ids 表示名称，labels 表示标签，parents 表示对应的父节点，如果没有父节点，可以用""表示。

关键点：需要把每个节点之间的关系描述清楚。笨办法：画个手稿，根据手稿一条条写。

或者你可以直接构造一个 .csv 文件，进行导入，类似：

绘图

数据构建完毕后，绘图就是一行代码的事情了～

plotly 绘制得到的是 HTML 文件，可以进行交互。读者可以通过点击不同区域进行交互，例如：

当然，plot_ly() 中包含很多参数，包括 maxdepth 显示最大深度结构可视化。color 修改颜色，size 修改尺寸等。此外还可在该图基础上，通过管道函数继续添加内容，设置不同区块的比例等。拓展内容可见官网^[6]，这里不做具体介绍了（太多啦！）。

保存 PDF 图形

如果你想将该图用到科研论文中（存储为 PDF），还需要进行以下操作：

• 第一种方法：

首先需要在操作系统上安装 orca^[7] 库（需要点时间）。之后使用代码：

• 第二种方法：

输出为 Web Page，然后通过打印的形式保存为 PDF，可能还需要使用裁剪 PDF 的工具，例如：avepdf^[8]。

参考资料

推荐： 可以保存以下照片，在b站扫该二维码，或者b站搜索【庄闪闪】观看Rmarkdown系列的视频教程。Rmarkdown视频新增两节视频（写轮眼幻灯片制作）需要视频内的文档，可在公众号回复【rmarkdown】