ReaxFF反应力场计算开发与应用

课程

内容

第一天 上午

ReaxFF基础理论

1.  ReaxFF反应力场概述

1.1. ReaxFF反应力场的发展历程和基础

1.2. ReaxFF反应力场参数分枝与详解

1.3. ReaxFF反应力场的应用领域

第一天 下午

ReaxFF基础入门

2.  ReaxFF反应力场基础入门

2.1. 所需输入重要文件详解包括 control,  geo, ffield等文件

2.2. 结合实例，讲解输入文件命令行，输出文件

2.3. ReaxFF反应力场简单实例操作及结果查看

2.4. ReaxFF反应力场运行软件安装和配置(standalone ReaxFF,LAMMPS)

2.5. ReaxFF 反应力场的选取和准备

第二天 上午

ReaxFF计算软件

3.  分子建模，可视与计算软件

3.1. 建模软件gview, material studio

3.2. 可视软件molden, VMD, OVITO

3.3. ReaxFF计算软件 standalone ReaxFF, LAMMPS

3.4  ReaxFF 特殊功能介绍：改变温度体积，产生特定比例混合物，设置电荷，限制优化和扫描，添加删除分子，结果查看和分析等

第二天 下午

ReaxFF计算软件

4.  Lammps实例操作

4.1. LAMMPS运行设置和后处理程序软件ChemTraYzer等的安装和配置

4.2. Lammps燃烧过程简单例子（模拟和分析）

4.3. LAMMPS高级算例：模拟化学摩擦过程（CMP）：建模，loading和shearing过程模拟，结果分析等

第三天 上午

ReaxFF进阶实例

5.  ReaxFF进阶实例操作，理解计算模拟的过程及物理意义

实例操作：溶液中的质子转移(JPCB,JPCL文献)

5.1. 建立初始模型：重点注意事项(minimization->nvt->compress->npt->nvt)

5.2. 输入文件设置, 开启输出unfolded坐标文件

5.3. 模拟步骤：能量最小化，压缩，系综平衡等

5.4. VMD查看结果分析：msd，扩散系数，rdf，sdf, 质子追踪等

第三天 下午

ReaxFF进阶实例

实例操作：碳化硅表面石墨烯的生长（Chem. Mater文献）

5.5. 建模与输入文件，表面选取与准备

5.6. 热分解法生长石墨烯，删除表面硅

5.7. cvd法生长石墨烯，添加乙炔分子

5.8. 可视评估石墨烯质量 （模拟结果统计与可视化）

第四天 上午

ReaxFF高级实例

6.  量子化学软件CP2K入门

6.1. CP2K基本功能介绍

6.2. CP2K的下载和安装

6.3. CP2K的结构文件的建模

6.4. CP2K输入文件讲解和建立

6.5. CP2K输出文件介绍和可视化转化

第四天 下午

ReaxFF高级实例

7.  CP2K结构优化、过渡态搜索和力场开发实例

7.1. CP2K研究有机分子在固体表面的吸附

7.2. CP2K过渡态计算以及结构和能量提取

7.3. ReaxFF反应力场开发所需文件详解

7.4. 提取CP2K计算结果实现ReaxFF训练集的构建

7.5. ReaxFF力场验证

交流互动环节

针对学员的问题一一作答