Bedford更新新冠病毒分子流行病学分析；关乎疫情走向，这三个突变株最为重要。。。

我们公众号经常发布美国病毒进化学家Trevor Bedford博士的研究报告，大家深深地被Bedford博士的专业和准确所折服。

Trevor Bedford博士于2022年4月18日更新了对于多种Omicron亚型的分子流行病学分析，非常重要。

这组推文共有17条的新冠病毒解析，关乎到今后几个月全球疫情的走向。

我们特做以解读。

传播速度更快、免疫逃逸更强，这将是未来新冠病毒新突变株的突出优势；

对于我们人类，则不得不做好“在未来某个时间与新冠病毒不期而遇”的准备。

（图源：Trevor Bedford博士的推特）

2，目前Omicron BA.2已经成为全球主流毒株。

不管是欧洲、亚洲、非洲，还是澳洲，目前的主流毒株都是OMicron BA.2。

Omicron BA.2也是在中国内地造成新一波疫情的主流毒株。

（图源：Trevor Bedford博士的推特）

4，Omicron突变株最重要的是452突变。

新冠病毒新毒株的传染性和毒力都是由其突变位点决定的。

Bedford认为，目前新冠病毒突变株、尤其是Omicron重要亚型中最重要的是452突变，这个突变位点十分关键。

不管是纽约发现的BA.2亚型的子亚型BA.2.12.1，还是在南非发现且快速蔓延的BA.4和BA.5，都有452突变。

因为它具有S704L和L452Q两个新突变，而众所周知，L452是Delta突变株的最关键突变，L452使Delta具有传播优势，因此具有L452的BA.2.12.1十分重要。

美国纽约州3月初BA.2.12.1只占检出病例1%，但到了4月初已经占到了18%。

美国麻省在3月初检出率1%，到了4月初为7%。

由此计算出BA.2.12.1的相对增长速度大约在0.06-0.11，比BA.2更快；这一增速也是BA.2相对BA.1的增长速度。

6，BA.4和BA.5更为复杂。

BA.4和BA.5也有和Delta完全一致的突变L452R（不是BA.2.12.1的L452Q），还具有F486V和回复突变Q493R。

BA.4和BA.5已经成为南非部分省的主流毒株

BA.4出现在去年发现Omicron的Gauteng，到4月为止BA.4已经占据了当地检出的60%；

而BA.5则在KwaZulu-Natal流行，到4月已经占据了当地的55%。

BA.4的相对增长速度大约为0.09，BA.5为0.11，与BA.2.12.1大致相同。

可见L452突变对于这3种亚型在分子流行上的影响具有相似性。

7，F486V突变可能会造成进一步的免疫逃逸

L452突变对病毒传播影响较大，但似乎对免疫逃逸影响较小；

相比之下，F486V这个突变可能会造成进一步的免疫逃逸。

Bedford预测，具有L452R/Q突变的BA.2.12.1，BA.4和BA.5等具有Omicron叠加Delta关键突变的毒株更有传播优势，因此有可能会成为今后的主要流行突变株；但也有可能Omicron其他突变亚型的出现会与携带L452R/Q的Omicron相竞争。

8，突变驱动着新冠病毒的宿主适应和抗原漂移

随着Omicron亚型进化的加剧，Omicron越来越表现出类似流感的抗原漂移的特征，毒力也趋于稳定或减弱，这种流行病学趋势越来越像季节性流感。

参考资料：

【1】 https://twitter.com/trvrb/status/1516147494010253318

本期编辑：Henry，微信号healsan。

Hanson临床科研团队，由6位在美国的医生及医学科学家组成；目前在美国主要从事新药研发和临床科研。

作者：王宇歌博士，一直在美国从事病毒新药和疫苗研发。微博：子陵在听歌。

更多有用的免费资源：

（点击👆图片，进入自己感兴趣的专辑。或获得点击“资源”，浏览本公众号所有资源。）

👇推荐靠谱的SCI论文服务