新冠病毒进化保持在了Omicron内卷这一趋势中
用数据,来辨清事实。
关键词:COVID-19;新冠病毒;进化
导言:
2022年10月20,美国俄亥俄州立大学病毒学家刘善虑团队针对BQ.1.1等最新突变株的最新研究发布在bioRxiv,非常清楚地解释了新毒株非常强悍的免疫逃逸能力 【1】。
(目前主要毒株的来源及突变位点。图源:刘善虑团队研究,Hanson临床科研做了修改)
2022年10月23日,北大的曹云龙在推特上传了一组最新的BQ.1和BQ.1.1血清学数据,直言:即使接种疫苗后再感染Omicron BA.1,到7.5个月时大多数血清几乎不会中和BQ.1.1和XBB 【2】。
一系列高质量的研究结果,让我们有机会再次回顾和展望新冠病毒的进化趋势。
一直在美国从事病毒新药/疫苗研发的王宇歌博士在这些结果做了解读。
我从9月开始一种关注CDC COVID Data Tracker,以判断今年秋冬Omicron亚型的趋势变化。
(2022年10月22日美国检测到的新冠毒株分布)
CDC在10月22日发布的最新数据显示,BA.5原始型比例从10月15日的70.2%在一周内降低到了62.2%。
而在BA.5 Spike引入K444T, N460K的BQ.1从5.8%上升到9.4%。在BQ.1上进一步引入R346T的BQ.1.1,也是我在一个月前微博中说到的目前SARS-CoV-2突变的最极限形式,从3.6%上升到了7.2%。
根据BQ.1和BQ.1.1的大致倍增时间,以及从目前的趋势来看,BQ.1和BQ.1.1很可能是今年冬天乃至明年春天全球流行的Omicron亚型。
我在九月强调,一种新亚型取代旧的亚型需要不断发生免疫逃逸,使旧亚型形成的免疫力无法预防新亚型的重复感染。
10月23日,北大的曹云龙在推特上传了一组最新的BQ.1和BQ.1.1血清学数据。
结果显示:3剂CoronaVac接种后发生Omicron BA.1突破性感染一个月后血清对BA.1中和滴度为852,对BA.5为107,对BQ.1为32,对BQ.1.1为27。
而突破性感染发生7.5个月后,血清对BQ.1和BQ.1.1完全失去中和活性。
这个推特数据没有BA.5突破性感染对于BQ.1和BQ.1.1的中和滴度,因此无法判断BQ.1和BQ.1.1对BA.5形成的体液免疫的免疫逃逸,相信何大一、刘善虑等发表突变株血清学研究最迅速的研究组会很快发表这一数据。
(3剂免疫、BA.1疫情和BA.5疫情期感染者血清对不同毒株的免疫活性)
但不论结果如何,相信在BA.5 Spike之上进一步发生2-3个突变的BQ.1和BQ.1.1会产生更明显的逃逸,这从目前CDC公布的Omicron亚型的比例变化可见一斑。
小结:
Omicron是病毒进化的一种集大成形式。
这一年多的规律是,新的Omicron亚型在其祖先Omicron亚型上发生氨基酸突变进一步逃逸免疫应答。
目前SARS-CoV-2进化保持在了Omicron内卷这一进化趋势中。
人类不得不持续更新疫苗,以获得预防重症/病死的保护力。
【1】 https://twitter.com/yunlong_cao/status/1584232974689521667
【2】 https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.10.19.512891v1.full.pdf
本期编辑:Henry,微信号healsan。
Hanson临床科研团队,由6位在美国的医生及医学科学家组成;目前在美国主要从事新药研发和临床科研。
作者简介:王宇歌 博士,一直在美国从事病毒新药和疫苗研发。微博:子陵在听歌。
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