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AIDD专题


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AIDD

人工智能药物发现

2023年1月11日-1月15日

在线直播(授课5天)


课程通过机器学习、深度学习的分类回归任务、 分子特征、模型评估、参数优化与模型选择、浅层机器学习分类虚拟筛选、集成机器学习方法、DNN,GCN,GAT等主流深度学习模型实操以及结合相关课题的应用实践等内容,带您真正的进入人工智能药物发现的领域。


01

课程大纲

AIDD人工智能(机器学习与深度学习)药物发现专题


时间

课程内容

课程内容

第一天上午

计算机辅助药物分子设计

1.计算机辅助药物设计(CADD)简介
2.CADD的基本方法
2.1分子对接
2.2药效团
2.3 QSAR和QSPR
2.4 各类药学研究数据库的介绍

第一天下午

Anaconda3的安装配置

3.Anaconda3
3.1 Pandas
3.2 NumPy
3.3 RDKit
3.4 scikit-learn
3.5 Pytorch
3.6 Tensorflow
3.7 DeepChem
3.8 XGBoost

第二天上午

AIDD简介

——分类和回归任务

1.分类模型的构建与应用
1.1逻辑回归算法原理
1.2朴素贝叶斯算法原理
1.3k最近邻算法原理
1.4支持向量机算法原理
1.5随机森林算法原理
1.6梯度提升算法原理
2. 分子特征介绍
2.1 分子描述符  2.2 分子指纹  2.3分子图

第二天下午

基于浅层机器学习的药物发现(目标:引导学员自行实现基于其他三种算法如KNN,SVM,XGBoost的毒性预测模型,并用于小分子化合物的毒性预测)

3.模型评估方法
3.1交叉验证
3.2外部验证
3.3分类模型的常用评价指标
3.4混淆矩阵
3.5准确率
3.6敏感性
3.7特异性
4.参数优化与模型选择
4.1超参数优化4.2 模型选择的标准
模型实例讲解与练习(文献复现):
Ø  给定数据集为例,基于随机森林算法的CYPs抑制剂相关毒性预测模型的构建与使用

第三天上午

基于浅层学习的药物发现——回归任务

 

1.回归模型的构建与应用
2.回归模型的常用评价指标
2.1 MSE 
2.2 MAE  
2.3 R2
3.模型选择
3.1超参数优化
3.2最优模型选择

第三天下午

基于浅层学习分类的虚拟筛选(目标:引导学员自行实现基于其他三种算法的pIC50值预测模型,并用于小分子化合物pIC50值的预测)

模型实例讲解与练习(文献复现):
Ø  以微管蛋白为例,机器学习分类任务在药物发现中的实战作用
Ø  给定数据集为例,基于随机森林算法的pIC50值预测模型构建与使用

第四天

基于深度学习的药物发现

1.深度学习的发展历程
1.1深度学习在药物开发中的应用
1.2 DNN
1.3 GCN
1.4 GAT
1.5 KGCN
1.6 FP-GNN
2.深度神经网络的常用框架介绍
2.1 PyTorch
2.2 TensorFlow
3.DEEPCHEM介绍与使用
模型实例讲解与练习(文献复现):
Ø  DEEPCHEM集成的机器学习方法和加载使用

第五天

使用DNN,GCN,GAT等主流深度学习模型进行实操

实例讲解与练习(文献复现):
Ø  给定数据集为例,使用DNN,GCN,GAT等主流深度学习模型进行小分子抗乳腺活性预测
Ø  乳腺预测的基本思路,逻辑和课题设计
基于图模型的F1分数(A);基于图模型的AUC结果(B);基于分子图的不同亚型细胞的最优模型(C)

部分案例:


02

报名费用



费用提供用于报销的正规机打发票及盖有公章的纸质通知文件;

如需开具会议费的单位请联系招生老师发送会议邀请函;

年底免费大赠送:(赠送的免费课程不开发票)

1)  报名CADD专题课程,可任选AMBER专题、GROMACS专题、AIDD专题课程之一免费参加

2)  报名AIDD专题课程,可任选AMBER专题、GROMACS专题课程之一免费参加

3)报名AMBER专题课程,可免费参加GROMACS专题课程


03

增值服务

1.  年底大赠送:凡报名价格高的专题课程,可任选一个比所报课程价格低的课程免费参加;

2.  凡报名学员将获得本次培训书本(或电子)教材以便提前预习及随堂电子资料;

3.  凡报名学员将获得课程相关Windows版本软件安装指导(一年有效期);

4.  提供无限次回放视频:凡报名学员课程结束后可获得所学专题课程无限次回放视频;

5.  价格优惠:(优惠活动最终解释权归主办方)

1)  早鸟优惠:所有专题课程2022年12月31日前报名缴费均立减200元

2)  转发优惠:转发本文/海报至朋友圈12小时,优惠100元/人(朋友圈不设屏蔽,截图联系工作人员确认)

3)  凡老学员推荐的新报名者可享受额外优惠

4)  老学员优惠:老学员参加任一新课程立减400元(与1)2)不叠加)

6.  学员提出的各自遇到的问题在课程结束后可以长期得到老师的解答与指导;

参加培训并通过考试的学员,可以获得:北京软研国际信息技术研究院培训中心颁发的《计算机辅助药物设计应用工程师》专业技能结业证书


04

联系方式


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