早诊早治，防止致残——JPM 关节炎专题精选文章 | MDPI 编辑荐读

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关节炎是最常见的慢性疾病之一，严重者将导致关节残疾、影响患者生活质量。JPM 倡导“早诊早治，防止致残”，重视关节保护，远离关节炎。本期编辑荐读为您精选 JPM 期刊发表的关节炎相关研究文章，希望能为关节炎病理及临床研究人员提供新的思路，欢迎阅读。

# 01

Complex Machine-Learning Algorithms and Multivariable Logistic Regression on Par in the Prediction of Insufficient Clinical Response to Methotrexate in Rheumatoid Arthritis

复杂机器学习算法和多变量逻辑回归分析在预测类风湿性关节炎对甲氨蝶呤治疗临床反应不足中表现相当

Helen R. Gosselt et al.

https://www.mdpi.com/960096

逻辑回归、LASSO、随机森林和 XGBoost 在预测患者治疗 3 个月后对甲氨蝶呤反应不足的基线特征的特征重要性图。

文章亮点：

(1) 本研究采用逻辑回归、最小绝对收缩和选择算子 (LASSO)、随机森林和极限梯度增强 (XGBoost) 模型，对预测甲氨蝶呤 (MTX) 治疗反应不足方面进行了分析和评估。

(2) 本文以受试者工作特征 (ROC) 曲线下面积 (AUC)、95% 置信区间  (95% CI)、敏感性和特异性等为参数，对模型性能进行比较，研究结果科学可信。

(3) 研究表明，逻辑回归在预测 MTX 治疗反应不足方面的表现与机器学习算法相当。

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原文出自 JPM 期刊

Gosselt, H.R.; Verhoeven, M.M.A.; Bulatović-Ćalasan, M.; Welsing, P.M.; de Rotte, M.C.F.J.; Hazes, J.M.W.; Lafeber, F.P.J.G.; Hoogendoorn, M.; de Jonge, R. Complex Machine-Learning Algorithms and Multivariable Logistic Regression on Par in the Prediction of Insufficient Clinical Response to Methotrexate in Rheumatoid Arthritis. J. Pers. Med. 2021,11, 44.

# 02

Prognostic Factors for Radiographic Progression in Patients with Seronegative Rheumatoid Arthritis

血清阴性类风湿关节炎患者影像学进展的预后因素

Eun-Jung Park, WooSeong Jeong and Jinseok Kim

https://www.mdpi.com/1022992

图片来自：https://www.freepik.com.

文章亮点：

(1) 本研究采用线性回归分析，确定了血清阴性类风湿关节炎 (Rheumatoid Arthritis, RA) 影像学进展的预测因素，并描述了血清阴性 RA 患者之间有或无影像学损伤的不同特征。

(2) 在调整年龄、性别、症状持续时间、活动性滑膜炎数量和 C-反应蛋白水平后，血清阴性 RA 患者的影像学损伤和诊断时 Sharp—van der Heijde (SvdH) 评分与影像学进展显著相关。

(3)血清阴性 RA 患者的放射学损伤率与最近的研究相当，存在侵蚀和诊断时的 SvdH 评分是预测放射损伤的关键因素。

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原文出自 JPM 期刊

Zhou, J.-Y.; Park, S. Associations of Polygenetic Variants at the 11q23 Locus and Their Interactions with Macronutrient Intake for the Risk of 3GO, a Combination of Hypertension, Hyperglycemia, and Dyslipidemia. J. Pers. Med. 2021, 11, 207. 

# 03

Influence of the FCGR2A rs1801274 and FCGR3A rs396991 Polymorphisms on Response to Abatacept in Patients with Rheumatoid Arthritis

FCGR2A rs1801274 和 FCGR3A rs396991 多态性对类风湿性关节炎患者对阿巴西普反应的影响

Noelia Márquez Pete et al

https://www.mdpi.com/1155292

图文摘要。

文章亮点：

(1) 本研究评估了类风湿性关节炎 (RA) 确诊患者在治疗 6 个月和 12 个月后，FCGR2A rs1801274、FCGR3A rs396991 SNPs 和低亲和性 FCGR2A/FCGR3A 单倍型作为阿巴西普 (Abatacept, ABA) 应答生物标志物的可能性。

(2) 研究表明，高亲和性 FCGR2A-p.131His 的患者和低亲和性 FCGR3A-p.158Phe 可能与 RA 患者对 ABA 更好的治疗反应相关。

(3) FCGR2A 和 FCGR3A 低亲和等位基因的存在，与 ABA 治疗后更强的临床疗效和更低的低疾病活动度 (Low Disease Activity, LDA) 相关。

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原文出自 JPM 期刊

Márquez Pete, N.; Maldonado Montoro, M.d.M.; Pérez Ramírez, C.; Martínez Martínez, F.; Martínez de la Plata, J.E.; Daddaoua, A.; Jiménez Morales, A. Influence of the FCGR2A rs1801274 and FCGR3A rs396991 Polymorphisms on Response to Abatacept in Patients with Rheumatoid Arthritis. J. Pers. Med. 2021, 11, 573.

# 04

Inference of an Integrative, Executable Network forRheumatoid Arthritis Combining Data-Driven Machine Learning Approaches and aState-of-the-Art Mechanistic Disease Map

结合数据驱动的机器学习方法和最先进的机制疾病图推断类风湿性关节炎的综合可执行网络

Quentin Miagoux et al.

https://www.mdpi.com/1225732

类风湿性关节炎 (RA) 创建一个综合的和可执行的网络的工作流程。

文章亮点：

(1) 本研究通过使用与 RA 相关的公开转录组数据集 (外周血) 和机器学习法，创建了 RA 特异性转录因子 (Transcription Factor, TF) 协同调节网络。

(2) 本文将整合网络作为模板，分析对抗 TNF 治疗反应的患者数据，并识别受治疗影响的主调控因子和上游级联反应。

(3) 本文使用布尔形式来模拟集成网络的生物信息学部分，并识别可以打开或关闭已识别 TF 的组合和条件，以模拟单个扰动和组合扰动的影响。            

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原文出自 JPM 期刊

Miagoux, Q.; Singh, V.; de Mézquita, D.; Chaudru, V.; Elati, M.; Petit-Teixeira, E.; Niarakis, A. Inference of an Integrative, Executable Network for Rheumatoid Arthritis Combining Data-Driven Machine Learning Approaches and a State-of-the-Art Mechanistic Disease Map. J. Pers. Med. 2021, 11, 785. 

# 05

MetabolomicBiomarker Candidates for Skeletal Muscle Loss in the Collagen-Induced Arthritis(CIA) Model

胶原诱导关节炎 (CIA) 模型骨骼肌损失的代谢组学生物标志物候选

PauloV. G. Alabarse et al.

https://www.mdpi.com/1244138

图文摘要。

文章亮点：

(1) 本文研究了与胶原诱导关节炎 (Comprised Collagen-induced Arthritis, CIA) 动物肌肉质量损失相关的尿代谢组学特征。

(2) 研究发现，由于组氨酸途径与肌肉缺损存在很强的关系，3-甲基组氨酸和肌肽均被确定为肌肉损失的生物标记物。

(3) 精氨酸和脯氨酸代谢在 RA 肌肉流失过程中起到一定作用。另外，磷酸肌酸代谢物、甘氨酸、丝氨酸和苏氨酸等氨基酸代谢物也是评估 RA 中肌肉损失诊断的生物标志物。

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原文出自 JPM 期刊

Alabarse, P.V.G.; Silva, J.M.S.; Santo, R.C.E.; Oliveira, M.S.; Almeida, A.S.; de Oliveira, M.S.; Immig, M.L.; Freitas, E.C.; Teixeira, V.O.N.; Bathurst, C.L.; Brenol, C.V.; Filippin, L.I.; Young, S.P.; Lora, P.S.; Xavier, R.M. Metabolomic Biomarker Candidates for Skeletal Muscle Loss in the Collagen-Induced Arthritis (CIA) Model. J. Pers. Med. 2021, 11, 837. 

文案审校

孙有良 博士研究生

清华大学药学院

Moon Liao 博士研究生

中国科学院上海巴斯德研究所

       JPM 期刊介绍

主编：David Alan Rizzieri, Novant Health Cancer Institute, USA

期刊涵盖与个性化医疗相关的前沿、创新的临床前和转化科学研究及技术 (如精准医疗、药物基因组学/蛋白质组学、系统生物学、组学关联分析)，将个性化医疗的各个方面整合至一个平台上，为学术和临床研究人、生物技术、诊断和制药公司、卫生专业人员、监管和伦理专家以及政府和监管当局提供论坛。

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