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[变异毒株]Lambda的绝地反攻

拍老师 拍照稀烂的焦虑怪 2021-11-25
大周末的,走点独家原创内容呗~

今天咱来八卦八卦新冠病毒变异毒株南美三雄之一的Lambda(C.37)。
也许关注境外疫情形势的各位会奇怪~
Delta正在Lambda的老家秘鲁大杀特杀呢,
Lambda早已变成昨日黄花~
——请品鉴:

就这副风中残烛的造型,还要拿出来搞原创~
难道是想炒冷饭?

这点请各位放心,咱们家绝对没有冷饭,
每一坨焦虑都是新鲜热辣现炒现卖



照惯例,咱先来复习一下Lambda(C.37)的生平得了~
Lambda于2020年12月份几乎同时在秘鲁和阿根廷检出。
咱们根据流行率变化趋势来推测,
这货应该于更早时间诞生于秘鲁,
然后2020年底逐渐扩散到邻国智利和阿根廷。

——Lambda的刺突蛋白突变位点如下:

G75V+T76I+246/252DEL+L452Q+F490S+D614G+T859N

简单解说一下,通常我们认为,这货主要的威胁有三部分:NTD域的G75V+T76I双突变、246-252位点缺失突变,以及RBD域的L452Q+F490S双突变。

——各个突变的具体分析如下:
↑ 上表是用假病毒模拟的Lambda刺突蛋白各个突变位点传染性测定(以D614G为基准),其中G75V/T76I组合可以增强传染性近1倍,L452Q/F490S组合则可以增强传染性1.5倍。

——以及,如下:

↑ 上表是用假病毒模拟的Lambda刺突蛋白各个突变位点针对BNT疫苗接种后血清的抗体中和测定(还是以D614G为基准),其中246-252位点缺失突变的免疫逃逸能力翻了1.42倍,L452Q/F490S组合的免疫逃逸能力则翻了1.62倍。



粗略地说,我们衡量某毒株的实力,主要看传染性免疫逃逸能力毒力这老三样,而上述突变点位组合起来之后,Lambda的实力简直是六边形(三角形)战士……

——请品鉴:
↑ 上图是全球42个国家各种病毒株流行率增长速度元数据分析拟合结果~
中间的标杆(黑色虚线)是Alpha,
其他毒株则用黑点表示。黑点越靠右,就意味着流行率增长速率相对alpha越大。
可以看出,Lambda的传染性仅次于Delta和Mu,跻身Top 3

——请再品鉴:
↑ 上图BNT疫苗、moderna疫苗和强生疫苗分别针对6种不同毒株的中和抗体测定。其中每个毒株的纵坐标是中和抗体滴度(IC50),横坐标是分别是三种疫苗,图中每个小圆点代表一次中和试验结果,小圆点中间的那条短横线是多次试验结果的中位数。短横线的位置越高代表抗体对毒株的中和效果越好,越低则代表毒株的免疫逃逸能力越强。
可以看出,Lambda的免疫逃逸能力仅次于Beta,甩了Alpha和Delta两条街~
(当然了,免疫逃逸这块儿的竞争异常激烈,top 3名次变动频繁……现如今Lambda早已掉出榜单了)

——请接着品鉴:

↑ 上面是Lambda老家秘鲁的病死率(紫红色)对照全世界平均病死率(绿色)。灰色阴影区间是Lambda流行期间。
病死率超过10%可还行?

——直接死麻了:



当然了,我们现在知道,

毒株间的竞争,远比人类之间的竞争更加内卷,

所以Lambda被Delta给一波长江后浪推前浪直接带走,是很正常的发展方向,

——请品鉴:

↑ 秘鲁、智利、阿根廷三国的毒株流行率变化图。其中橘红色的C.37从2020年11月开始快速扩大市场份额,在2021年5-6月到达顶峰,最后在2021年8月之后被Delta挤压到灭绝边缘。



但故事并没有结束,反而峰回路转……

下面进入各位期待已久的贩卖焦虑环节
我们不妨先复习复习一下这一篇:[每日一焦]论神一般的变异毒株是怎样诞生的

在上文中我们已经看到,

根据Sebastian Duchene老师的偶发突变加速(episodic increased evolutionary rate)假说,

——请品鉴:


类似于Delta和Lambda这样拿到专属希腊字母认证的赢家毒株,

它们个个都可谓是天命之选、气运之子,

各自都有不凡的武林奇遇,

都曾经在短时间内爆发出6倍于背景速率的偶发快速突变
一口气凑齐满身的阴间突变位点,
然后迅速变身为超级赛亚人,
在残酷的病毒内卷中占尽优势,
最终一桶浆糊。

——比如我们熟悉的四大VOC,它们的武林奇遇分别(可能)是这样的:
  • Alpha的武林奇遇可能是跨物种传播和回传;
  • Beta和Gamma的武林奇遇可能是免疫受损感染者+持续感染;
  • Delta的武林奇遇则可能是免疫受损感染者+高抗体阳性率人群+大规模超级传播者事件。

然而,还有一种令人无比焦虑的可能性……


虽然偶发突变加速是一种小概率事件

以至于疫情两年以来,全球享受到武林奇遇的毒株两只手都数得过来~


但是啊但是……

有没有可能,哪款毒株能够前后踩中两次狗屎?经历两次偶发突变加速?


就如同《龙珠》里的桥段一样,

先变身超级赛亚人~

——请品鉴:


再变身为超级超级赛亚人~

——请再品鉴:


答案是:完全有可能。


就在今天,人们发现,

Lambda已经完成了第二次偶发快速突变


——请品鉴:

↑ 9月28日,秘鲁北部Lambayeque地区检出6例二段变身完成的Lambda~

——突变情况如下:

↑刺突蛋白部分标红的,全都是元祖版Lambda没有的全新突变,一共9个
其中RBD(受体结合域)有4个——A475V、E484K、P499R和N501T
NTD(N端结构域)还有3个——L5F、144DELD253N
FCS(弗林蛋白酶切割点)又有2个——H655YP681R
(刺突蛋白以外还额外有10个


惊不惊喜刺不刺激?


所以……

前段时间到处推销Delta是“新冠病毒最佳适应阶段”的小丑们,

敢不敢出来走两步?

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