来源：澎湃新闻（ID：thepapernews）

记者：贺梨萍、张若婷

论文通过对目前为止最大规模的103个新冠病毒全基因组分子进化分析，发现病毒株已发生了149个突变点，而且多数是近期产生的。该研究揭示：新冠病毒已经演化出L和S两个亚型。

新冠病毒是否已经发生突变？如何突变？这是目前学界研究的焦点之一。中国科研团队最新发现显示：新冠病毒已于近期产生了149个突变点，并演化出了两个亚型，分别是L亚型和S亚型。

研究发现，在地域分布及人群中的比例，这两个亚型表现出了很大差异。其中S型是相对更古老的版本，而L亚型更具侵略性传染力更强。对不同亚型的深入了解，将有助于新冠肺炎的差异化的治疗和防控。

以上研究来自中国科学院主办的《国家科学评论》（National Science Review）于3月3日发表的论文《关于SARS-CoV-2的起源和持续进化》（On the origin and continuing evolution of SARS-CoV-2）。

论文通讯作者为陆剑研究员（北京大学生命科学学院生物信息中心）、崔杰研究员（中国科学院上海巴斯德研究所）。

论文通过对目前为止最大规模的103个新冠病毒全基因组分子进化分析，发现病毒株已发生了149个突变点，而且多数是近期产生的。该研究揭示：新冠病毒已经演化出L和S两个亚型。其中101个属于这两个亚型。从占比上看，L亚型更为普遍达到70%，S亚型占30%。

论文作者认为，根据新型冠状病毒的演变方式推测，L亚型和S亚型的传播能力、致病严重程度或许存在较大区别。

论文称，两个亚型的区别在于病毒RNA基因组的第28144位点，L亚型是T碱基（对应亮氨酸，Leu），S亚型是C碱基（对应丝氨酸，Ser）。通过与其他冠状病毒比较，作者发现S型新冠病毒与蝙蝠来源的冠状病毒在进化树上更接近，从而得出S型相对更古老的结论。

L亚型在武汉暴发的早期阶段更为普遍，而L亚型的发生频率在2020年1月初后有所下降。作者认为，人为干预可能对L亚型施加了更大的选择性压力，如果没有这些干预，L亚型可能更具侵略性和扩散得更快速。

另一方面，由于选择压力相对较弱，在进化上较老且攻击性较小的S型可能在相对频率上有所增加。这些发现意味着，目前迫切需要结合基因组数据、流行病学数据和2019年冠状病毒病患者临床症状图表记录，进行进一步的全面研究。

另外，值得注意的是，这103个样本显示，大部分患者只感染了L亚型或S亚型中的一个。但其中一位近期有过武汉旅行史的美国患者分离出的病毒株，显示其可能同时感染了L型和S型新冠病毒。不过，作者表示目前还无法排除新突变型的可能性。

延伸阅读

从“五个家族”到“两个亚型”， 新冠病毒变了吗？

来源：中国新闻网

国内外研究均指向病毒突变，但筛选标准不同

国内外均有研究明确病毒发生突变，但基于突变的归纳分类并不一致。对此，一位长期关注相关问题的生物学家4日告诉记者，病毒总会突变，分类就像是把病毒过筛，而“筛子”的形状、“筛孔”的粗细，决定了划分类型和分类数量。

这位生物学家强调，真正得出确切的分类，还需将基因组序列变化与发病时间、发病地区、传播路线、临床表现等病毒在真实世界的表现对应起来。

以科研团队对SARS(严重急性呼吸综合征)病毒的追踪为例。2004年1月30日，全国防治非典科技攻关组和广东省防治非典科技攻关领导小组宣布，中国科学家经过8个月的联合攻关，在流行病学和分子进化概念上定义了2002/2003年间SARS流行的早、中、晚三期，也定义了每一阶段的基因组分子标记，由此解析出SARS冠状病毒分子进化规律。

需指出的是，相较于全球已有的新冠肺炎确诊病例人数来说，目前仅有130余条基因组序列被分析和上传。有学者呼吁对全球范围内，特别是对武汉地区的新冠肺炎患者进行大规模病毒基因序列分析，同时结合患者的发病情况开展分析，才能得出更可靠的结论。

怎样看突变？无需过度恐慌

得知新冠病毒发生突变，人们不免担忧病毒是否已出现变异甚至是进化？这里需先厘清概念，生物学大致将变异分为“突变”和“基因重组”两方面。

《自然—微生物学》2月19日刊发的一篇来自耶鲁大学、悉尼大学等高校科研人员的评论文章回答说：突变是病毒生命周期的一个自然组成部分，尤其对于RNA病毒来说，突变“见怪不怪”。突变可使病毒毒性增强，也可使其减弱。而病毒的毒性和传播方式等是由多个基因控制，换句话说，需要多个突变才能进化。任何关于突变后果的说法都需要实验和流行病学证据，“不该对病毒突变感到恐慌”。

梳理近期研究也可发现一些“好消息”。来自中科院版纳热带植物园的研究称“新型冠状病毒基因组没有发生重组事件”；南方医科大学学者发现117个突变点相对均匀地分布在整个基因组，表明“尚未出现特别‘激进’的变异之处”。中国—世界卫生组织新型冠状病毒肺炎联合专家考察组也表示，新冠病毒尚未发现明显变异。

中山大学附属第三医院感染科副主任、《国际病毒学杂志》副主编林炳亮4日对中新社记者说，发生突变可能改变病毒的致病性和传播性，“理论上多数疾病经过传播，致病性会减弱，但有些也会增强，比如更容易吸附细胞”，这将对防控和临床产生影响，因此需要进一步观察和研究。

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