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肿瘤二代测序LDT建设为何是医院的迫切需求?

基因谷 基因谷 2022-07-07

高通量测序技术(next generation sequencing technology,NGS)的发展使基因组学得到迅猛发展,从而推动了精准医学理念的建立和推广。NGS检测通量大、精确度高、信息量丰富,并且具有所需标本量小、总体成本低等特点,在医学研究及临床检测中得到广泛应用。近年来,NGS的发展极大地推动了分子诊断技术在临床无创产前筛查、肿瘤诊断与治疗、感染性病原体检测、遗传性疾病诊断、器官移植等领域诊断中的应用,并在疾病治疗中发挥越来越重要的作用。但是医院在开展高通量测序技术时,往往面临着是IVD模式还是LDT模式的选择。

目前,体外诊断产品主要有两种途径服务于患者,即将经过药品监管部门审批注册的医疗器械和试剂盒产品提供给医疗机构,并由后者服务于终端消费者的IVD 模式,以及由经过认证的实验室自行研发、验证、生产并只在实验室内部使用的LDT 模式,从满足患者需求和医院长远发展角度来说,肿瘤二代测序LDT项目建设已经成为众多二三级医院的迫切需求:

一、NGS是发展迅猛的新技术


精准医疗的重要前提是精准诊断,个体化的治疗离不开个体化的诊断,采用新技术、新方法为临床提供精准信息成为医学检验发展趋势。随着检测技术水平的快速发展,在基于分子和基因层面的个体化医疗和精准医疗兴起的背景下,下一代测序、液质联用技术、流式细胞技术等已在临床广泛应用。新的检测方法层出不穷,适应精准医疗和个体化医疗的目的,它们的共有特点为特异性较强,检测仪器设备复杂,检测试剂通常需要根据不同需求配制,难以使用标准化固定配方的商品化检测试剂盒。LDT 模式由经过认证的实验室按需求自行研发及使用检测方法,具有更大的灵活性,能完成从实验室到临床的快速转化,从而更好地满足患者的需求。

NGS技术和产品本身的非标准化和快速的升级迭代,尤其是肿瘤基因检测特异性较高、覆盖区域和靶点非常丰富,一定程度上存在难以完全满足药品监管机构批准的标准化、商品化IVD试剂盒条件的挑战,因此以LDT的形式由医疗机构自主内部验证和使用,及时惠及患者指导用药就显得各外重要。其次,某些新的检测项目临床应用数量相对较少,实验对象较为局限,难达到临床性能验证要求而无法按照传统的上市监管得到批准。目前国内已经批准的小panel NGS试剂盒所覆盖的基因和位点都非常少,没有突出NGS本身的技术优势,也不能继续快速升级迭代,无法满足临床的真正需求,因此这些企业的获证产品销量根本上不去。很多已经获批的小小panel NGS试剂盒,并没有在临床中真正使用,而且实际操作中还是变相地以LDT的形式通过大Panel进行检测。另外值得关注的是,在国际上很多NGS的肿瘤Panel都是以LDT的形式存在了一定的时间,部分后期获得了FDA的注册,但很大一部分还是以LDT的形式存在,比较典型的例如Foundation Medicine公司的FoundationOne Heme试剂盒等等。

因此,肿瘤NGS检测项目以LDT 模式开始得到应用是发展过程中的必经阶段,将可促进我国医学检验新方法、新技术的应用及发展,进而推动个体化医学和精准医学的临床应用和发展。临床实验室自建检测方法(LDT)的兴起一定程度上适应了精准医学检测的发展,在精准医疗的大趋势下,加快推进LDT项目建设,是将最新的前沿技术服务于临床的大势所趋。

二、强大的政策支持和临床共识


LDT模式通过医疗机构批准拿到认证牌照,认证后该实验室研发、设计、制造的临床诊断产品无需再获得审批,即可用于研究或对外提供检测服务,发展机会大、符合政策引导。满足临床需求是医学检验的存在基础,医学检验的发展离不开LDT,在欧美等发达国家, LDT模式是一种常见的模式,美国对基因检测技术采用了有效兼顾监管和鼓励创新的LDT模式。在此模式下,只要是有临床实验室改进修正案(CLIA)执照的实验室,其研发的产品和技术服务就可以合法进入临床,合理收费。实验室取得CLIA标准相关认证后,检测结果即可用于指导临床诊疗。该管理方式自实施以来,得到了患者、医院、第三方临检中心、保险公司的广泛认可,目前美国有近2.5万个CLIA实验室。尤其是在NGS等新技术领域,在医院和临床实验室广泛应用。临床实验室自建项目(LDT)项目在欧美蓬勃发展的同时,我们国家和很多有识之士也看到了医院建设肿瘤二代测序LDT项目的迫切需求。

2021年6月,国家发布了《医疗器械监督管理条例》(739号令),739号令第五十三条规定,对国内尚无同品种产品上市的体外诊断试剂,符合条件的医疗机构根据本单位的临床需要,可以自行研制。建议国家相关职能部门“以临床需求为导向”、“以解决临床问题为出发点”,帮助医疗机构解决成果转化“最后一公里”的“卡脖子”关键问题,为LDT在临床开展检测创造良好条件,指导医疗机构开发NGS检测项目,并应用于临床实践。实现临床应用合规合法,促进领域健康发展。2021 年 7月 15 日,国务院发布《关于支持浦东革开放打造社会主义现代化建设引领区的意见》,第四条明确提出:在浦东新区范围内允许有条件的医疗机构按照相关要求开展自行研制体外诊断试剂试点。2022年全国两会期间,全国人大代表、广州医科大学附属市八医院感染病中心首席专家蔡卫平在全国两会上提交《关于加快推进医学检验实验室自建检测方法服务于临床的建议》。他表示:“对于我国医学检验部门现状而言,发展LDT的需求非常紧迫。”全国政协委员陈赛娟提交提案:《关于大力推进基于“第二代测序” 临床实验室自建项目(LDT)开展的建议》。这份提案认为,首先应尽快在医疗机构开展临床实验室自建项目(Laboratory developed test, 简称“LDT”)。2022年5月5日,广州市人民政府公报发布《广州市人民政府办公厅关于印发广州市战略性新兴产业发展“十四五”规划的通知》,文件中提出:瞄准精准医疗、智慧医疗需求,依托基因检测和个体化治疗技术进步,构建精准诊疗平台和临床转化体系,建设国际领先的精准医疗中心。积极支持实验室自建检测方法(LDT)试点,有条件允许LDT项目服务于临床推广。

无论是从社会反响还是政策指引来说,二三级医院建设肿瘤二代测序LDT实验室都是主流方向,但医院完全独立建设也有很多困难,医疗机构设立院内的肿瘤NGS实验室既需要满足自动化、高精度技术要求,又要符合医疗机构管理规范,同时又要面临极大的前期投入,随着技术平台端的选择面越来越广,基因检测公司与医院合作,将肿瘤NGS从院外的区域中心实验室搬到院内,成为这个行业新的主流趋势,医院与品牌基因检测公司共建实验室成为肿瘤NGS实验室的主要方法。

三、有利于提升医院科研实力和患者满意度


目前来看,基因检测公司的主流临床服务模式有三种:一是招募代理商打通医院渠道,通过医生推荐的方式向患者提供服务;二是向医院提供IVD体外诊断产品,通过医院采购入院;三是LDT自建实验室,公司与医院合作建立实验室,为医院提供从人员培训、样本检测到科研产出一整套的服务支持。对于基因检测厂商而言,服务场景从院外转移到院内,服务内容从单纯的检测服务或试剂,转变为完整的实验室解决方案,与医院的业务绑定更深。

设立院内NGS实验室以后,医院也可以大幅度降低开展这类项目的成本,压缩周转时间。中国医学科学院肿瘤医院病理科主任应建明表示,快速、准确及合规的基因检测对医院实施临床肿瘤诊治至关主要。首都医科大学肺癌诊疗中心主任、首都医科大学宣武医院胸外科首席专家支修益则认为,建立院内NGS实验室能够为病人档案建设提供新武器,帮助医院完善信息化系统。对医院来说,这种模式也有利于提升自身科研实力与学科影响力。基因检测公司提供的专业技术支持,以及患者检测后的大量临床样本,都对科研成果产出很有帮助。基因检测公司在医院建立实验室,通过正规竞标流程入院,提供系统的人员培训、技术配备,从而为整个医院的患者提供基因检测服务。同时,由于LDT入院需要经过严格的筛选与把关,产品的质量较为可靠,定价也更加公开、透明、低廉。对于患者而言,就医、标本采集、检测、治疗都在医院内完成,不但可以最大限度的保护患者隐私,同时能够更省心、放心。减少了医患纠纷和医疗投诉的发生。长远来看,患者更有可能从中获益。


参考文献:《我国临床实验室自建检测方法管理优化及对策建议》

《高通量测序技术在五类疾病分子诊断中的应用及质量管理策略》



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