R语言基础(2)-向量|矩阵|数组|数据框|数据IO|实用函数
"pythonic生物人"的第85篇分享
本文梳理R语言数据结构：向量、矩阵、数据框； 数据IO及实用函数。
本文速览
更多精彩：pythonic生物人
1、c()创建向量(Vector)
向量创建
查看向量数据类型
向量切片
2、matrix()创建矩阵(matrix)
语法
创建矩阵
矩阵切片
3、data.frame()创建数据框
语法
创建数据框
数据框切片
4、R中数据导入|输出
R支持数据导入方式
R中数据Import/Export包
5、R处理数据对象实用函数
1、c()创建向量(Vector)
向量创建
a <- c(1, 2, 5, 3, 6, -2, 4)#创建向量a
a
查看向量数据类型
向量切片
a[c(1, 4)]#提取a中的第一和第四个元素，向量中索引从1开始，区别于python从0开始
a[1:4]#提取1到4个元素#等价于a[c(1:4)]
2、 matrix()创建矩阵(matrix)
语法
myymatrix <- matrix(vector, nrow=number_of_rows, ncol=number_of_columns,
byrow=logical_value, dimnames=list(
char_vector_rownames, char_vector_colnames))
vector 矩阵的元素
nrow和ncol 指定行和列的维数
dimnames 行名和列名
byrow 按行填充（byrow=TRUE）按列填充（byrow=FALSE） ，默认情况下按列填充。
创建矩阵
cells <- c(1,26,'aa',68)
rnames <- c("R1", "R2")
cnames <- c("C1", "C2")
mymatrix <- matrix(cells, nrow=2, ncol=2, byrow=TRUE, dimnames=list(rnames, cnames))
矩阵切片
print('#取第一行')
print(mymatrix[1,])
print('#取第一列')
print( mymatrix[,1])
print('#取第一行，1，2列')
print(mymatrix[1,c(1,2)])
3、data.frame()创建数据框
语法
mydata <- data.frame(col1, col2, col3,...)
其中的列向量col1、 col2、 col3等可为任何类型（如字符型、数值型或逻辑型）。每一列的名
称可由函数names指定。
创建数据框
patientID <- c(1, 2, 3, 4)
age <- c(25, 34, 28, 52)
diabetes <- c("Type1", "Type2", "Type1", "Type1")
status <- c("Poor", "Improved", "Excellent", "Poor")
patientdata <- data.frame(patientID, age, diabetes, status)
print(patientdata)
数据框切片
print('#提取1，2列')
print(patientdata[1:2])#数字指定
print('#提取diabetes,status列')
print(patientdata[c("diabetes", "status")])#列名指定
print('#提取age列')#$列名指定
print(patientdata$age)
4、R中数据导入|输出
R支持数据导入方式
R中数据Import/Export包
会涉及到如下多种包：
参考: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN//doc/manuals/R-data.pdf
DBI (https://CRAN.R-project.org/package=DBI):#包名称及CRAN地址
David A. James#包作者
dataframes2xls (https://CRAN.R-project.org/package=dataframes2xls):
Guido van Steen
foreign (https://CRAN.R-project.org/package=foreign):
Thomas Lumley, Saikat DebRoy, Douglas Bates, Duncan Murdoch and
Roger Bivand
gdata (https://CRAN.R-project.org/package=gdata):
Gregory R. Warnes
ncdf4 (https://CRAN.R-project.org/package=ncdf4):
David Pierce
rJava (https://CRAN.R-project.org/package=rJava):
Simon Urbanek
RJDBC (https://CRAN.R-project.org/package=RJDBC):
Simon Urbanek
RMySQL (https://CRAN.R-project.org/package=RMySQL):
David James and Saikat DebRoy
RNetCDF (https://CRAN.R-project.org/package=RNetCDF):
Pavel Michna
RODBC (https://CRAN.R-project.org/package=RODBC):
Michael Lapsley and Brian Ripley
ROracle (https://CRAN.R-project.org/package=ROracle):
David A. James
RPostgreSQL (https://CRAN.R-project.org/package=RPostgreSQL):
Sameer Kumar Prayaga and Tomoaki Nishiyama
RSPerl: Duncan Temple Lang
RSPython:
Duncan Temple Lang
RSQLite (https://CRAN.R-project.org/package=RSQLite):
David A. James
SJava: John Chambers and Duncan Temple Lang
WriteXLS (https://CRAN.R-project.org/package=WriteXLS):
Marc Schwartz
XLConnect (https://CRAN.R-project.org/package=XLConnect):
Mirai Solutions GmbH
XML (https://CRAN.R-project.org/package=XML):
Duncan Temple Lang
5、R处理数据对象实用函数
函 数 用 途
length(object) 显示对象中元素/成分的数量
dim(object) 显示某个对象的维度
str(object) 显示某个对象的结构
class(object) 显示某个对象的类或类型
names(object) 显示某对象中各成分的名称
c(object, object,...) 将对象合并入一个向量
cbind(object, object, ...) 按列合并对象
rbind(object, object, ...) 按行合并对象
head(object) 列出某个对象的开始部分
tail(object) 列出某个对象的最后部分
参考资料
r-in-action-second-edition