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详解mRNA用于癌症免疫治疗的几种策略

慕羽 生物药论 2023-12-01




癌症免疫疗法在对抗恶性肿瘤方面有巨大的潜力。信使核糖核酸(mRNA)是近来研究火热的一种通用工具,在细胞质内发挥作用,消除了在以往质粒DNA (pDNA)中的无意插入或突变的风险(图1),具有编码肿瘤抗原(TA)免疫细胞受体细胞因子抗体的能力,而mRNA固有的结构不稳定性,因而需要开发有效的递送系统。脂质纳米颗粒(LNPs)已成为癌症免疫疗法中mRNA递送的重要介质之一,为mRNA提供保护并提高细胞内递送效率。

这里将讨论基于LNP的mRNA递送系统在癌症免疫治疗中各种应用的最新进展,包括mRNA编码的肿瘤疫苗、工程化CAR-T、佐剂、细胞因子和抗体,重点是优化癌症治疗中mRNA编码疗法的设计和递送策略。此外,也将深入研究该领域遇到的挑战,并展望未来的前景,旨在提高基于LNP的mRNA癌症免疫疗法的安全性和有效性。

▲图1 基因传递过程示意图,突出显示pDNA和mRNA途径。利用外源mRNA编码的靶抗原,通过MHC I类和II类分子肽呈递,激活细胞和体液免疫反应,最终有助于消除肿瘤。

1LNPs用于mRNA递送

LNPs可以作为包裹小分子、核酸、小干扰RNA (siRNA)和mRNA的药物递送系统,由可电离脂质、辅助脂质、胆固醇、聚乙二醇(PEG)脂质和mRNA组成(图2a)。可电离脂质的特点是其pH敏感性,由于其头部基团具有转移电荷的能力,可从低pH下的正电荷状态过渡到生理pH下的中性状态,这种特性使它们能够形成“mRNA离子化的阳离子脂质”复合物,以ph依赖的方式稳定和保护mRNA。另一个关键成分,PEG-脂质,通过避免巨噬细胞的活化和吞噬作用,延长体循环,增强稳定性。PEG-脂质的选择取决于PEG的摩尔质量和脂质长度,可以影响靶向递送和细胞摄取效率。辅助性脂质和胆固醇在LNP形成过程中起重要作用,控制LNP的流动性或刚性。特别是胆固醇,会影响LNP的有效递送和分布,通过特定的修饰还可以选择性靶向某种细胞类型。

▲图2  LNPs的组成及其作为递送载体的优势

2基于mRNA-LNPs肿瘤免疫治疗策略

基于LNP的mRNA癌症免疫治疗主要采用四种策略(图3):

(1)通过编码肿瘤抗原(TA)激活免疫应答

(2)表达抗原受体,如CAR或T细胞受体(TCR)

(3)编码佐剂刺激免疫

(4)编码免疫相关蛋白(如细胞因子、抗体)

下面将详细叙述这几种方法的研究进展

▲图3  基于LNP的mRNA递送策略示意图。

2.1策略:癌抗原提呈

TA是癌细胞中表达的蛋白质,被免疫系统识别为外源,通过抗原呈递细胞(APCs)呈递给T细胞和B细胞,这可以诱导强大的抗癌免疫反应。主要有全长蛋白、抗原肽或编码特定癌症抗原的pDNA几种形式。有研究以为个性化新抗原作为树突状细胞(DC)疫苗,具有有效的抗肿瘤作用。在临床试验中,评估了自体肿瘤mRNA在恶性黑色素瘤中引发免疫反应的可行性(Phase I/II trial of melanoma therapy with dendritic cells transfected with autologous tumor-mRNA)。mRNA编码TA转染的DC已成为一种有效的癌症治疗策略,在脑癌、前列腺癌、肾细胞癌和黑色素瘤的临床试验中显示出长期生存率。值得注意的是,50%的转移性黑色素瘤患者单独接种DC疫苗或联合使用白细胞介素(IL)-2,长期生存无严重不良反应。鉴于这些抗肿瘤作用,Oberli等人优化了LNPs,并在黑色素瘤体内模型中证明mRNA编码的TA在细胞内递送至APCs,促进细胞毒性CD8 + T细胞反应。另一项研究中(DOI:10.1016/j.biomaterials.2020.120431),在OVA荷瘤小鼠模型中,LNP-OVA mRNA和C16-R848能有效抑制肿瘤生长(图4a-f)。Sasaki等人报道了利用微流体装置选择合适的尺寸和脂质组成来优化LNPs的方法,该研究通过递送E.G7-OVA mRNA,并将其与其他两种LNP配方进行比较,结果显示A-11-LNP为最佳配方。A-11-LNP组在DC中表现出优越的基因表达活性和成熟程度,在E.G7-OVA肿瘤模型中表现出明显的抗肿瘤治疗作用。

▲图4 mRNA-LNPs癌症疫苗 (a). 加载mRNA的LNPs的示意图和实验方法。(b). A11-LNPs对E.G7-OVA荷瘤小鼠的抗肿瘤活性。(c). 分别于第8天和第11天静脉注射含OVA mRNA的制剂,以0.03 mg mRNA/kg剂量注射A-11-LNPs、MC3-LNP、RNA-LPX和B-8-LNPs对E.G7-OVA荷瘤小鼠的抗肿瘤活性。(d - f ). 以0.03 mg mRNA/kg剂量静脉注射OVA mRNA制剂24 h后脾脏DCs中活化标记物CD40 (d)、CD80 (e)和CD86 (f)的表达。(g). 接种疫苗和抽血的实验时间表。(h). 第12天用113-O12B/mOVA和ALC-0315/mOVA处理小鼠的OVA特异性抗体滴度。(i). 第二次接种后第7天CD3 + CD8 + T细胞内IFN-γ阳性细胞流式图。(j). B16F10-OVA肿瘤模型的肿瘤体积。 (k). 静脉注射B16F10-OVA细胞18天后采集的肺。
在另外一项研究中,Chen等人报道了一种基于LNPs的淋巴结靶向mRNA疫苗,命名为113-O12B,用于癌症免疫治疗(图4 g-k)。在携带B16F10-OVA的体内模型中,将mRNA靶向递送到淋巴结引发了CD8 + T细胞对编码的全长OVA的强烈反应

2.2


策略:CAR工程化免疫细胞

工程免疫细胞疗法可以特异性识别癌症细胞,具有治疗癌症的潜力。mRNA编码的CAR在体外或体内递送至免疫细胞,并表达在细胞表面靶向癌症细胞。几项临床/临床前研究已经证明了mRNA编码的CARs在癌症免疫治疗中的潜力(DOI:10.1016/j.ymthe.2019.01.018)。Billingsley等人通过开发可电离脂质和用各种组合优化LNP文库,证明基于LNP递送mRNA平台生成的CAR-T细胞治疗可行性(图5)。LNP包封的编码CD19 CAR的mRNA与电穿孔相同或更高的水平表达CD19 CAR基于这种方式产生的CAR还可以应用到NK细胞疗法,尽管这种方式更具潜力,但目前应用更多的还是病毒载体。

▲图5  编码CAR的mRNA-LNP递送系统。(a) 使用CAR mRNA负载的LNP靶向T细胞的示意图。(b) 使用微流体技术生成LNP。(c)通过流式分析CAR在原代T细胞中的表达率,纯化的LNP和电穿孔(EP)组中的CAR在T细胞上表达增加。(d)细胞活力评估,LNP对细胞的损伤相较电穿孔更小。
基于mRNA的CAR的一个显著限制性因素是表达的持续时间相对较短,这种短暂性表达可能会限制其治疗效果,为了克服这一挑战,研究人员正在探索提高mRNA稳定性和延长CAR表达持续时间的策略,包括优化mRNA序列和结构,优化LNP制剂增强细胞内递送和释放,使mRNA编码的CARs能够持续或重复给药。

2.3策略:佐剂

免疫原性佐剂调节有助于抗原识别、共刺激分子上调和细胞因子产生的信号。Toll样受体(TLRs)识别多种病原体中存在的保守结构,并触发先天免疫反应,特别是I型干扰素(IFN)的产生。由于TLR激动剂能够连接先天免疫反应和适应性免疫反应,因此作为癌症的佐剂是非常有前途的。干扰素基因刺激因子(STING)是一种在先天免疫反应中发挥关键作用的蛋白质,STING的激活触发转录因子(干扰素调节因子,IRF-3)和CD8+T细胞的免疫信号级联。由于其在免疫反应中的核心作用,STING已成为开发癌症免疫疗法的一种有前途的研究方向。
在一项研究中,将LNP封装的mRNA疫苗与佐剂(IFN基因刺激因子STING-V155M突变)相结合,增强了临床前模型和临床研究中的免疫反应(图6)(DOI:10.1016/j.ymthe.2021.03.002)。该佐剂最初在一名婴儿期发作的STING相关血管病(SAVI)患者中发现,可以极大的提高CD8+T细胞,增加疫苗的免疫原性反应和通过核因子κB(NF-κB)和IFN刺激反应元件(ISRE)激活I型IFN途径。当与靶向人乳头瘤病毒(HPV)癌蛋白的mRNA疫苗一起使用时STING-V155M在接种疫苗的小鼠中降低了肿瘤生长并提高了存活率,这些表明mRNA编码的佐剂在癌症免疫疗法中的潜力。

▲图6  mRNA编码佐剂的LNP递送系统。(a) 用编码STING的mRNA-LNPs治疗后C57BL/6小鼠血清中的细胞因子水平。(b)用编码STING的mRNA-LNPs治疗后脾脏中IFN-γ、TNF-α和IL-2的流式分析。(c)E6/E7中观察到的肺转移减少。(d) 用编码STING的mRNA-LNPs处理小鼠的存活率。

2.4策略:编码免疫相关蛋白~细胞因子

细胞因子在调节免疫系统功能方面起着关键作用,是首批癌症治疗药物之一。IFN-α和IL-2是白血病、转移性癌症和黑色素瘤的代表性免疫治疗剂。然而,以往制剂方法已经暴露了很多问题,如直接注射蛋白半衰期短,大量注射又会导致全身毒性,再有pDNA存在的不可控基因整合风险及表达效率低等。为了克服这些问题,编码细胞因子的mRNA和递送系统备受关注。
IL-12被称为一种T细胞刺激因子,在临床前模型中显示出强大的抗癌活性,但在血液中扩散后也会引起全身毒性。有研究利用LNP包封编码IL-12和lumican的mRNALumican将IL-12保留在肿瘤微环境(TME)中,减少副作用。LNPs包裹的mRNA诱导免疫原性细胞死亡(ICD)在体外和体内得到证实,导致I型IFN、TLR3的有效诱导,并增强TME内的免疫记忆(图第7a、b)。

▲图7  编码细胞因子的mRNA-LNP递送系统。(a) 引发肿瘤免疫的示意图。(b)用编码IL-12的mRNA-LNPs处理的B16F10肿瘤模型中的肿瘤体积和存活率。(c) 测量编码IL-23、IL-36γ和OX40L的mRNA-LNP处理的肿瘤体积,在MC38-R肿瘤模型中显示出抗癌作用。(d)编码IL-23、IL-36γ和OX40L的mRNA-LNPs处理引起的肿瘤体积缩小。(e) 编码IL-12、IL-27和GM-CSF的mRNA-LNP递送系统示意图。(f) 用IL-27、IL-12或GM-CSF mRNA负载的MC3 LNP或DAL4 LNP处理后的细胞因子浓度。(g) 在用DAL4 LNP包封的mRNA处理的B16F10小鼠模型中测量的肿瘤大小。(H) 用mRNA负载的DAL4 LNPs处理的B16F10小鼠模型中的存活率。

IL-1和IL-12家族协同进行抗炎和抗肿瘤免疫反应。IL-1家族(IL-1、IL-18、IL-33、IL-36、IL-37和IL-38)参与抗原侵袭后的早期免疫反应。已知IL-36与癌症的良好预后相关,并刺激APC和T细胞。IL-12家族细胞因子是先天免疫和适应性免疫之间的桥梁。IL-23是IL-12家族的一员,调节免疫反应并表现出抗肿瘤作用。Hewitt等人设计了编码OX40、IL-36和IL-23的mRNA-LNP的递送系统对肿瘤进行单药治疗和联合治疗(图7c,d)。LNP递送的三种(OX40、IL-36和IL-23)mRNA有效地激活了DC和T细胞与单独的mRNA相比抗癌效果显著增强。这些策略引发了先天和适应性免疫反应,使肿瘤再次受到攻击,也能有效地预防肿瘤复发。在另一项研究中,证明了使用编码细胞因子的mRNA-LNP进行抗癌治疗(图7e–h)(DOI:10.1016/j.jconrel.2022.03.021)。这些细胞因子(IL-12、IL-27和GM-CSF)表现出协同作用,增加T细胞在TME中的存活率,并用IFN-γ和IL-10促进记忆性T细胞,在黑色素留模型中具有显著的肿瘤抑制作用,且没有毒性。IL-12和IL-27的组合吸引了B细胞、巨噬细胞、CD4+/CD8+T细胞和NK细胞证明了多种细胞因子的mRNA-LNP递送系统聚集免疫细胞并提供有效治疗的潜力

2.4策略:编码免疫相关蛋白~抗体

抗体治疗在临床上取得了卓越的疗效,然而仍存在一定的局限性。稳定性问题、大规模制造的复杂性和治疗成本可能会阻碍其广泛应用。通过递送编码抗体的mRNA在体内产生抗体,这种方法可以解决目前抗体存在的局限性和挑战。HER2抗体(即曲妥珠单抗)是靶向HER2治疗癌症的鲜明例子,当曲妥珠单抗与癌症细胞的HER2结合时,它通过阻断癌症细胞的增殖和存活途径达到抗癌作用。基于这一机制,Rybakova等人通过LNP递送表达曲妥珠单抗的mRNA(图8a–d)(DOI:10.1016/j.ymthe.2019.05.012)。在将其注射到小鼠中,血清中表达的曲妥珠抗体的浓度逐渐增加,直到7天后消失(图8c)。这意味着编码抗体的mRNA-LNP递送可替代传统抗体疗法

▲图8  编码抗体的mRNA-LNP递送系统。(a) 编码曲妥珠单抗重链和轻链的mRNA的示意图。(b) 在通过尾静脉以不同剂量注射曲妥珠单抗mRNA的cKK-E12 LNPs后24小时,C57BL/6小鼠血清中的曲妥珠单抗浓度。(c) 单次静脉注射8 mg/kg赫赛汀(Genentech)或2 mg/kg cKK-E12 LNPs后,曲妥珠单抗在C57BL/6小鼠血清中的药代曲线。(d)用曲妥珠单抗mRNA治疗的小鼠中HER2阴性(MDA-MB-231)和HER2阳性(MDA-MB-231-HER2)肿瘤的生长,箭头表示mRNA LNP注射的天数。(e)IVT双(scFv)2和Fab-(scFv)2 RiboMABs的结构。(f) 注射脂质包封mRNA后内源性CD3×CLDN6 RiboMAB的体外细胞毒性(左)和浓度(Cp)(右)。 (g) 小鼠用CD3×CLDN6或荧光素酶mRNA处理(n = 6/组;3次剂量,静脉注射每周3µg/只),与纯化的CD3×CLDN6蛋白(200µg/kg)或对照(n = 7/组),每周腹腔注射3剂,共10剂,单个小鼠的肿瘤生长情况(左,mRNA;右,重组蛋白)。(h)小鼠用两剂量CD3×CLDN6 mRNA (n = 4)或荧光素酶mRNA作为阴性对照(n = 4)(均为3µg/小鼠每周静脉注射)。肿瘤浸润淋巴细胞(人CD3 +细胞;左)和表达CLDN6的肿瘤细胞(右)在三个连续的肿瘤切片中通过免疫组织化学进行定量。(i)在BHK细胞中表达的mRNA编码的利妥昔单抗与Raji细胞的结合。所示为所有活细胞的藻红蛋白(PE)荧光的中位数。(j–m)mRNA编码的单克隆抗体保护小鼠免受致命的肿瘤攻击。每组包括12只小鼠。(j)在肿瘤形成后的指定时间通过全身发光成像评估肿瘤发展。(k)接受静脉注射10或50µg编码利妥昔单抗的mRNA LNP的小鼠的存活率。(l)肿瘤形成后第13天,用两种不同剂量的编码利妥昔单抗的mRNA LNP处理的小鼠或未处理的小鼠的代表性发光图像。(m)接受静脉注射50µg编码利妥昔单抗或对照抗体的mRNA LNP或200µg重组利妥昔mab的小鼠的肿瘤发展。
Sahin的团队设计了编码CD3和Claudin6(CLDN6)(TAA之一)的RiboMABs的mRNA(图8e–h)(DOI:10.1038/nm.4356)。将CD3×CLDN6-RiboMAB LNPs注射小鼠后,随着时间的推移检测其在血清中的浓度,mRNA在144小时内逐渐减少,而抗体蛋白在给药6小时后迅速消失。与对照组和抗体蛋白治疗组相比,CD3×CLDN6 RiboMAB治疗卵巢癌异种移植小鼠模型可完全消除肿瘤。该研究表明,低剂量的基于LNP的mRNA可以重复给药和复制,可以持续产生抗体,克服了抗体疗法半衰期短的局限性,并展示了其潜在的临床应用性。

在另一项研究中,Thran等人探索了利妥昔单抗(用于靶向治疗淋巴瘤的CD20抗体)的用途,并研究了化学修饰的mRNA在被动免疫中的效用。他们设计了包裹在LNP中的利妥昔单抗mRNA,并评估了其抗肿瘤作用(图8i–m)(DOI:10.15252/emmm.201707678)。在体内淋巴瘤模型中,与用重组利妥昔单抗抗体治疗的组相比,用LNP mRNA治疗的组表现出更高的肿瘤抑制率和存活率。此外,单次注射mRNA-LNP足以实现快速、稳定和持久的血清抗体滴度,从而对致命的狂犬病感染或肉毒杆菌中毒提供预防和治疗保护。这些发现表明,编码抗体的mRNA-LNP比其重组蛋白提供更好的递送和治疗效果。

结论和未来展望
总之,基于mRNA的治疗策略近来备受关注,因为其制造简单,并且能够在没有基因组突变的情况下编码蛋白质。然而,由于mRNA结构不稳定,需要一种有效的载体或递送载体来增强内吞作用。随着纳米颗粒靶向递送技术的出现,LNP已成为一种创新的递送平台,可提高mRNA的稳定性和细胞内递送效率,使其成为癌症免疫疗法的极具前景的候选者。编码癌抗原、CAR、佐剂、细胞因子和抗体的mRNA也证明了减少肿瘤生长的潜力,进一步强调了LNP促进的基于mRNA的癌症免疫疗法的潜力。随着该领域的不断深入研究和开发,我们预计会出现更有效、更个性化、更安全的治疗方案。最终,这些迭代进步将会不断提高治疗效果,提升癌症患者的生活质量。


参考文献
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Stadler, C., Bähr-Mahmud, H., Celik, L. et al. Elimination of large tumors in mice by mRNA-encoded bispecific antibodies. Nat Med 23, 815–817 (2017).
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